Construction: XIIIe, agrandissement 1658
Rénovation: 1960 puis 2010
Dédiée à: Saint Germain d'Auxerre

L’église Saint-Germain est la première église paroissiale de Porrentruy.
La première mention écrite relative à celle-ci date du XIIe siècle.
Le sanctuaire que l’on peut voir actuellement a été construit au XIIIe siècle.
On peut diviser ce monument en deux parties :
le chœur qui est un bon exemple de transition entre le style roman tardif et le gothique ;
la nef est un agrandissement de l’église, datant de 1658, inspiré du style baroque.
Le chœur, par son architecture, crée une ambiance de recueillement et donne à l’église tout son charme.
Quant à la nef, elle est enrichie par de remarquables vitraux gothiques et de nombreuses fresques.
A remarquer, au sol, les dalles déplacées de l’église Saint-Pierre, au milieu du XVIIIe siècle, « mémorial » des familles bourgeoises et illustres de Porrentruy, à l’époque des princes-évêques.
A noter, l’excellente restauration de l’édifice, vers 1960, par l’architecte Alban Gerster.

Quant au cimetière (1783 – 1884), il contient les tombes de diverses personnalités des XVIIIe & XIXe siècles, telles que François Decker, Jules Thurmann, Xavier Stockmar, ainsi que des familles Billieux, Béchaux, Kohler, etc.

St-Germain est une des églises de la paroisse de Porrentruy. La messe y est célébrée le vendredi soir et le dimanche soir. D'autres temps de prière y sont aussi proposés régulièrement. Elle est également le lieu de rassemblement des communautés italienne, espagnole et portugaise.